Sujets)
Betacoronavirus/pathogénicité , Infections à coronavirus/complications , Pneumopathie virale/complications , Adulte , Sujet âgé , Maladies asymptomatiques , COVID-19 , Dépistage de la COVID-19 , Enfant , Techniques de laboratoire clinique , Traçage des contacts , Infections à coronavirus/diagnostic , Diagnostic différentiel , Dysenterie/étiologie , Maladies de l'oeil/étiologie , Humains , Adulte d'âge moyen , Maladies du système nerveux/étiologie , Troubles de l'olfaction/étiologie , Pandémies , Pneumopathie virale/diagnostic , SARS-CoV-2 , Troubles du goût/étiologieRésumé
A novel coronavirus (severe acute respiratory syndrome-CoV-2) that initially originated from Wuhan, China, in December 2019 has already caused a pandemic. While this novel coronavirus disease (COVID-19) frequently induces mild diseases, it has also generated severe diseases among certain populations, including older-aged individuals with underlying diseases, such as cardiovascular disease and diabetes. As of 31 March 2020, a total of 9786 confirmed cases with COVID-19 have been reported in South Korea. South Korea has the highest diagnostic rate for COVID-19, which has been the major contributor in overcoming this outbreak. We are trying to reduce the reproduction number of COVID-19 to less than one and eventually succeed in controlling this outbreak using methods such as contact tracing, quarantine, testing, isolation, social distancing and school closure. This report aimed to describe the current situation of COVID-19 in South Korea and our response to this outbreak.
Sujets)
Betacoronavirus/pathogénicité , COVID-19/épidémiologie , COVID-19/transmission , Contrôle des maladies transmissibles/organisation et administration , Infections à coronavirus/épidémiologie , Infections à coronavirus/transmission , Pandémies/prévention et contrôle , Pneumopathie virale/épidémiologie , Pneumopathie virale/transmission , Quarantaine/organisation et administration , Taux de reproduction de base , COVID-19/prévention et contrôle , Infections à coronavirus/prévention et contrôle , Surveillance épidémiologique , Médecine factuelle , Activités humaines , Humains , Distanciation physique , Pneumopathie virale/prévention et contrôle , République de Corée/épidémiologie , SARS-CoV-2 , VoyageSujets)
Betacoronavirus , Contrôle des maladies transmissibles , Infections à coronavirus , Transmission de maladie infectieuse , Santé mondiale/statistiques et données numériques , Pandémies , Pneumopathie virale , Betacoronavirus/isolement et purification , Betacoronavirus/pathogénicité , COVID-19 , Contrôle des maladies transmissibles/méthodes , Contrôle des maladies transmissibles/organisation et administration , Contrôle des maladies transmissibles/normes , Infections à coronavirus/épidémiologie , Infections à coronavirus/prévention et contrôle , Infections à coronavirus/transmission , Transmission de maladie infectieuse/prévention et contrôle , Transmission de maladie infectieuse/statistiques et données numériques , Humains , Internationalité , Mortalité , Pandémies/prévention et contrôle , Pneumopathie virale/épidémiologie , Pneumopathie virale/prévention et contrôle , Pneumopathie virale/transmission , Amélioration de la qualité , SARS-CoV-2Résumé
AIM: The COVID-19 pandemic is caused by infection with the SARS-CoV-2 virus. The major mutation detected to date in the SARS-CoV-2 viral envelope spike protein, which is responsible for virus attachment to the host and is also the main target for host antibodies, is a mutation of an aspartate (D) at position 614 found frequently in Chinese strains to a glycine (G). We sought to infer health impact of this mutation. RESULT: Increased case fatality rate correlated strongly with the proportion of viruses bearing G614 on a country by country basis. The amino acid at position 614 occurs at an internal protein interface of the viral spike, and the presence of G at this position was calculated to destabilise a specific conformation of the viral spike, within which the key host receptor binding site is more accessible. CONCLUSION: These results imply that G614 is a more pathogenic strain of SARS-CoV-2, which may influence vaccine design. The prevalence of this form of the virus should also be included in epidemiologic models predicting the COVID-19 health burden and fatality over time in specific regions. Physicians should be aware of this characteristic of the virus to anticipate the clinical course of infection.
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Betacoronavirus/génétique , Infections à coronavirus/mortalité , Mutation , Pneumopathie virale/mortalité , Glycoprotéine de spicule des coronavirus/génétique , Acide aspartique , Betacoronavirus/pathogénicité , Sites de fixation , COVID-19 , Glycine , Humains , Pandémies , SARS-CoV-2Sujets)
Betacoronavirus/physiologie , Infections à coronavirus/diagnostic , Pneumopathie virale/diagnostic , ARN viral/isolement et purification , Charge virale , Excrétion virale , Adulte , Sujet âgé , Betacoronavirus/pathogénicité , COVID-19 , Chine , Infections à coronavirus/virologie , Femelle , Humains , Mâle , Adulte d'âge moyen , Pandémies , Pneumopathie virale/virologie , SARS-CoV-2Sujets)
Betacoronavirus/pathogénicité , Érythème pernio/anatomopathologie , Érythème pernio/virologie , Infections à coronavirus/anatomopathologie , Infections à coronavirus/virologie , Pneumopathie virale/anatomopathologie , Pneumopathie virale/virologie , Administration par voie topique , Adolescent , Hormones corticosurrénaliennes , COVID-19 , Infections à coronavirus/immunologie , Test ELISA , Femelle , Doigts/vascularisation , Doigts/virologie , Humains , Pandémies , Éducation du patient comme sujet , Pneumopathie virale/immunologie , Quarantaine , SARS-CoV-2 , Orteils/vascularisation , Orteils/virologieSujets)
Production d'anticorps , Facilitation dépendante des anticorps , Betacoronavirus/pathogénicité , Infections à coronavirus/immunologie , Pneumopathie virale/immunologie , Betacoronavirus/immunologie , COVID-19 , Vaccins contre la COVID-19 , Chine , Coronavirus/pathogénicité , Infections à coronavirus/prévention et contrôle , Virus de la dengue/pathogénicité , Humains , Immunisation passive , Pandémies , Récepteurs au complément/métabolisme , Virus du SRAS/pathogénicité , SARS-CoV-2 , Indice de gravité de la maladie , Vaccination , Vaccins antiviraux/immunologieRésumé
Bat-origin RshSTT182 and RshSTT200 coronaviruses (CoV) from Rhinolophus shameli in Southeast Asia (Cambodia) share 92.6% whole-genome identity with SARS-CoV-2 and show identical receptor-binding domains (RBDs). In this study, we determined the structure of the RshSTT182/200 receptor binding domain (RBD) in complex with human angiotensin-converting enzyme 2 (hACE2) and identified the key residues that influence receptor binding. The binding of the RshSTT182/200 RBD to ACE2 orthologs from 39 animal species, including 18 bat species, was used to evaluate its host range. The RshSTT182/200 RBD broadly recognized 21 of 39 ACE2 orthologs, although its binding affinities for the orthologs were weaker than those of the RBD of SARS-CoV-2. Furthermore, RshSTT182 pseudovirus could utilize human, fox, and Rhinolophus affinis ACE2 receptors for cell entry. Moreover, we found that SARS-CoV-2 induces cross-neutralizing antibodies against RshSTT182 pseudovirus. Taken together, these findings indicate that RshSTT182/200 can potentially infect susceptible animals, but requires further evolution to obtain strong interspecies transmission abilities like SARS-CoV-2.
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Angiotensin-converting enzyme 2 , Betacoronavirus , Chiroptera , Glycoprotéine de spicule des coronavirus , Animaux , Humains , Angiotensin-converting enzyme 2/composition chimique , Angiotensin-converting enzyme 2/métabolisme , Chiroptera/métabolisme , Chiroptera/virologie , Spécificité d'hôte , Liaison aux protéines , Récepteurs viraux/composition chimique , Récepteurs viraux/métabolisme , SARS-CoV-2/métabolisme , Betacoronavirus/métabolisme , Betacoronavirus/pathogénicité , Glycoprotéine de spicule des coronavirus/composition chimique , Glycoprotéine de spicule des coronavirus/métabolismeSujets)
Anticoagulants/usage thérapeutique , Betacoronavirus/pathogénicité , Troubles de l'hémostase et de la coagulation/traitement médicamenteux , Coagulation sanguine/effets des médicaments et des substances chimiques , Infections à coronavirus/traitement médicamenteux , Périodiques comme sujet , Pneumopathie virale/traitement médicamenteux , Troubles de l'hémostase et de la coagulation/sang , Troubles de l'hémostase et de la coagulation/mortalité , Troubles de l'hémostase et de la coagulation/virologie , COVID-19 , Infections à coronavirus/sang , Infections à coronavirus/mortalité , Infections à coronavirus/virologie , Interactions hôte-pathogène , Humains , Pandémies , Pneumopathie virale/sang , Pneumopathie virale/mortalité , Pneumopathie virale/virologie , SARS-CoV-2 , Résultat thérapeutiqueRésumé
Temporal inference from laboratory testing results and triangulation with clinical outcomes extracted from unstructured electronic health record (EHR) provider notes is integral to advancing precision medicine. Here, we studied 246 SARS-CoV-2 PCR-positive (COVIDpos) patients and propensity-matched 2460 SARS-CoV-2 PCR-negative (COVIDneg) patients subjected to around 700,000 lab tests cumulatively across 194 assays. Compared to COVIDneg patients at the time of diagnostic testing, COVIDpos patients tended to have higher plasma fibrinogen levels and lower platelet counts. However, as the infection evolves, COVIDpos patients distinctively show declining fibrinogen, increasing platelet counts, and lower white blood cell counts. Augmented curation of EHRs suggests that only a minority of COVIDpos patients develop thromboembolism, and rarely, disseminated intravascular coagulopathy (DIC), with patients generally not displaying platelet reductions typical of consumptive coagulopathies. These temporal trends provide fine-grained resolution into COVID-19 associated coagulopathy (CAC) and set the stage for personalizing thromboprophylaxis.
Sujets)
Betacoronavirus/isolement et purification , Troubles de l'hémostase et de la coagulation/diagnostic , Tests de coagulation sanguine , Coagulation sanguine , Techniques de laboratoire clinique , Infections à coronavirus/diagnostic , Pneumopathie virale/diagnostic , Sujet âgé , Betacoronavirus/pathogénicité , Marqueurs biologiques/sang , Troubles de l'hémostase et de la coagulation/sang , Troubles de l'hémostase et de la coagulation/virologie , COVID-19 , Dépistage de la COVID-19 , Infections à coronavirus/sang , Infections à coronavirus/virologie , Évolution de la maladie , Femelle , Fibrinogène/métabolisme , Interactions hôte-microbes , Humains , Numération des leucocytes , Études longitudinales , Mâle , Adulte d'âge moyen , Pandémies , Numération des plaquettes , Pneumopathie virale/sang , Pneumopathie virale/virologie , Valeur prédictive des tests , Reproductibilité des résultats , Études rétrospectives , SARS-CoV-2 , Facteurs tempsSujets)
Infections à coronavirus/épidémiologie , Infections à coronavirus/étiologie , Coronavirus/pathogénicité , Pneumopathie virale/épidémiologie , Pneumopathie virale/étiologie , Betacoronavirus/métabolisme , Betacoronavirus/pathogénicité , COVID-19 , Coronavirus/métabolisme , Épidémies de maladies , Humains , Pandémies , SARS-CoV-2Résumé
Two recent Lancet and Lancet Oncology papers report that cancer patients with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection have higher mortality rates. Common independent factors associated with increased risk of death were older age, history of smoking status, number of comorbidities, more advanced performance status, and active cancer.
Sujets)
Betacoronavirus/pathogénicité , Infections à coronavirus/mortalité , Prévention des infections/normes , Transmission de maladie infectieuse du professionnel de santé au patient/prévention et contrôle , Tumeurs/mortalité , Pneumopathie virale/mortalité , Facteurs âges , Sujet âgé , Betacoronavirus/immunologie , COVID-19 , Infections à coronavirus/immunologie , Infections à coronavirus/transmission , Infections à coronavirus/virologie , Humains , Tumeurs/immunologie , Tumeurs/thérapie , Pandémies , Pneumopathie virale/immunologie , Pneumopathie virale/transmission , Pneumopathie virale/virologie , Appréciation des risques , Facteurs de risque , SARS-CoV-2Sujets)
Adaptation psychologique , Infections à coronavirus/épidémiologie , Infections à coronavirus/psychologie , Santé mondiale/tendances , Santé mentale/tendances , Pneumopathie virale/épidémiologie , Pneumopathie virale/psychologie , Psychiatrie/tendances , Betacoronavirus/pathogénicité , COVID-19 , Contrôle des maladies transmissibles , Émotions , Empathie , Humains , Pandémies , SARS-CoV-2Résumé
The SARS-CoV-2 pandemic is leading to high mortality and a global health crisis. The primary involvement is respiratory; however, the virus can also affect other organs, such as the gastrointestinal tract and liver. The most common symptoms are anorexia and diarrhea. In about half of the cases, viral RNA could be detected in the stool, which is another line of transmission and diagnosis. covid19 has a worse prognosis in patients with comorbidities, although there is not enough evidence in case of previous digestive diseases. Digestive endoscopies may give rise to aerosols, which make them techniques with a high risk of infection. Experts and scientific organizations worldwide have developed guidelines for preventive measures. The available evidence on gastrointestinal and hepatic involvement, the impact on patients with previous digestive diseases and operating guidelines for Endoscopy Units during the pandemic are reviewed.
Sujets)
Betacoronavirus/pathogénicité , Infections à coronavirus/complications , Maladies de l'appareil digestif/étiologie , Système digestif/virologie , Pandémies , Pneumopathie virale/complications , Aérosols , Angiotensin-converting enzyme 2 , Anorexie/étiologie , Antiviraux/effets indésirables , Betacoronavirus/isolement et purification , Betacoronavirus/physiologie , COVID-19 , Études de cohortes , Infections à coronavirus/traitement médicamenteux , Infections à coronavirus/prévention et contrôle , Infections à coronavirus/transmission , Diarrhée/étiologie , Maladies de l'appareil digestif/virologie , Endoscopie digestive/effets indésirables , Fèces/virologie , Humains , Immunosuppresseurs/effets indésirables , Intestins/composition chimique , Intestins/virologie , Maladies du foie/étiologie , Études multicentriques comme sujet , Pandémies/prévention et contrôle , Peptidyl-Dipeptidase A/analyse , Peptidyl-Dipeptidase A/physiologie , Équipement de protection individuelle , Pneumopathie virale/traitement médicamenteux , Pneumopathie virale/prévention et contrôle , Pneumopathie virale/transmission , Récepteurs viraux/analyse , Récepteurs viraux/physiologie , Risque , SARS-CoV-2 , Précautions universelles ,Sujets)
Hémorragie cérébrale/génétique , Planification de la santé communautaire , Infections à coronavirus/complications , Pneumopathie virale/complications , Accident vasculaire cérébral/complications , Betacoronavirus/pathogénicité , COVID-19 , Angiopathies intracrâniennes/génétique , Infections à coronavirus/virologie , Humains , État de New York , Pandémies , Pneumopathie virale/virologie , SARS-CoV-2Sujets)
Infections à coronavirus/génétique , Tumeurs/génétique , Pandémies , Pneumopathie virale/génétique , Interface utilisateur , Betacoronavirus/pathogénicité , COVID-19 , Infections à coronavirus/complications , Infections à coronavirus/épidémiologie , Humains , Tumeurs/complications , Tumeurs/épidémiologie , Tumeurs/virologie , Pneumopathie virale/complications , Pneumopathie virale/épidémiologie , SARS-CoV-2Sujets)
Betacoronavirus/pathogénicité , Prise de décision clinique , Infections à coronavirus/traitement médicamenteux , Infections à coronavirus/immunologie , Interleukine-6/antagonistes et inhibiteurs , Pneumopathie virale/traitement médicamenteux , Pneumopathie virale/immunologie , Stéroïdes/effets indésirables , Stéroïdes/usage thérapeutique , Incertitude , Anticorps monoclonaux humanisés/pharmacologie , Anticorps monoclonaux humanisés/usage thérapeutique , Betacoronavirus/effets des médicaments et des substances chimiques , Betacoronavirus/immunologie , COVID-19 , Infections à coronavirus/mortalité , Infections à coronavirus/anatomopathologie , Humains , Immunosuppresseurs/pharmacologie , Immunosuppresseurs/usage thérapeutique , Interleukine-6/immunologie , Macrophages/effets des médicaments et des substances chimiques , Macrophages/immunologie , Pandémies , Médecins/psychologie , Pneumopathie virale/mortalité , Pneumopathie virale/anatomopathologie , Essais contrôlés randomisés comme sujet , SARS-CoV-2 , Stéroïdes/administration et posologie , Stéroïdes/pharmacologie , Lymphocytes T/effets des médicaments et des substances chimiques , Lymphocytes T/immunologieSujets)
Infections à coronavirus , Publication en libre accès , Pandémies , Périodiques comme sujet , Pneumopathie virale , Recherche , Betacoronavirus/pathogénicité , COVID-19 , Contrôle des maladies transmissibles , Infections à coronavirus/traitement médicamenteux , Infections à coronavirus/économie , Infections à coronavirus/épidémiologie , Infections à coronavirus/virologie , Humains , Coopération internationale , Santé mentale , Pandémies/économie , Évaluation de la recherche par les pairs , Médecins/organisation et administration , Médecins/psychologie , Pneumopathie virale/traitement médicamenteux , Pneumopathie virale/économie , Pneumopathie virale/épidémiologie , Pneumopathie virale/virologie , Recherche/organisation et administration , Personnel de recherche/organisation et administration , Personnel de recherche/psychologie , Rapport de recherche , SARS-CoV-2 , Facteurs tempsRésumé
Respiratory immune characteristics associated with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) severity are currently unclear. We characterized bronchoalveolar lavage fluid immune cells from patients with varying severity of COVID-19 and from healthy people by using single-cell RNA sequencing. Proinflammatory monocyte-derived macrophages were abundant in the bronchoalveolar lavage fluid from patients with severe COVID-9. Moderate cases were characterized by the presence of highly clonally expanded CD8+ T cells. This atlas of the bronchoalveolar immune microenvironment suggests potential mechanisms underlying pathogenesis and recovery in COVID-19.